美里以及她率領的反NERV組織WILLE來到巴黎，這裡被核化染成紅色，Wunder戰艦降落在市區，船員們只有720秒能修復這個城市。當NERV派來襲擊的航空專用型EVA 44A出現時，真理駕駛8號機進行攔截並爭取時間。與此同時真嗣、明日香等人來到近第三次衝擊後，聚集了各處生還者的第三村，在此生活了一段時間，真嗣也與高中的友人重逢…… ——再見了，所有的新世紀福音戰士。 《新世紀福音戰士新劇場版》第四部，也是完結篇。眾人的結局將會如何？
